1962年7月,刘少军出生于长沙市,父亲刘筠当时在湖南师范学院(今湖南师范大学)任教,正致力于四大家鱼的繁殖生理学及人工繁殖技术研究。刘筠为鱼入痴,工作成狂。大女儿出生时,他在进行鲢鱼人工繁殖研究,为孩子取名刘白鲢。老二出生时,他在研究草鱼(又称鲩鱼),便为二儿子取名刘鲩。到第三个孩子出生时,刘筠还想取个带鱼的名字,同在学校任教的夫人坚决反对:“家里已经有了两条鱼,不能一家都是鱼。”最后,家中唯一没有以鱼取名的孩子刘少军反而跟父亲一样,成了毕生以鱼为伴的“鱼院士”。
刘少军记得,上幼儿园、上小学期间到了周末放假,父亲就用板车拖着一家人去偏远的渔场搞科研。在渔场,父亲忙实验,他就在岸边将不要的小鱼用罐头瓶装水养起来,就这样认识了草鱼、鲤鱼、鲫鱼那段难忘的日子,刘少军对鱼产生了浓厚的兴趣,更从父亲的言传身教中体会到了科研的艰苦和坚持的可贵。
紧随父亲脚步,刘少军把对鱼的爱好做成了职业乃至奋斗一生的事业。1989年,他留校在湖南师范大学生命科学学院任教选择了淡水鱼遗传育种研究作为自己的学术方向。1998年至1999年,他赴法国从事鱼类分子生物学研究工作;2007年,获国家杰出青年科学基金资助;2019年,当选中国工程院院士。刘少军在父亲开创建立的实验室接力前行,带领团队成功获批了淡水鱼类发育生物学国家重点实验室(省部共建)并担任主任。
2015年1月21日刘筠去世后,刘少军每年都会在年初写一封信致父亲。在信中,除简略汇报家人安好、表达怀念之情,其余皆是关于实验室的建设、团队的科研成果和刘筠生前捐资建立的“刘筠奖学金”助学成绩等情况。